Institut Laennec - Revisiter le défi DREAM5 sur l’inférence de réseaux de gènes en génétique génomique

Intervenant : Matthieu Vignes

École des Sciences Mathématiques et Informatiques, Massey University, NZ
Chercheur invité de l’institut Laënnec au sein de l’Institut de Mathématiques de Marseille (Hôte : Pierre Pudlo)

Titre : Revisiter le défi DREAM5 sur l’inférence de réseaux de gènes en génétique génomique : une rétrospective 10+ ans après

Résumé :

Notre équipe a participé au défi DREAM5 sur l’inférence de réseaux de gènes en génétique génomique. L’objectif était de reconstruire les relations de régulation connues à partir de données de marqueurs et d'expression génique. Je reviendrai sur ce défi, présenterai les méthodes que nous avons utilisées, les résultats globaux et détaillés obtenus. Je consacrerai également du temps à discuter de l’intégration des données, des stratégies générales et des (ce que je pense être) limitations des approches actuelles.

Ouvert à tous, avec un contenu mathématique très minimal !